MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118

Total Repeats: 4348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007930	TGT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962709
2	NC_007930	ATGA	2	8	103	110	50 %	25 %	25 %	0 %	90962709
3	NC_007930	TTC	2	6	127	132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962709
4	NC_007930	GAAA	2	8	163	170	75 %	0 %	25 %	0 %	90962709
5	NC_007930	AGA	2	6	215	220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962709
6	NC_007930	CAAA	2	8	224	231	75 %	0 %	0 %	25 %	90962709
7	NC_007930	ATA	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962709
8	NC_007930	ACA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962709
9	NC_007930	CAA	3	9	298	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962709
10	NC_007930	CAA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962709
11	NC_007930	TAAC	2	8	422	429	50 %	25 %	0 %	25 %	90962709
12	NC_007930	GAA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962709
13	NC_007930	TGT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962709
14	NC_007930	ATT	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962709
15	NC_007930	TAAA	2	8	763	770	75 %	25 %	0 %	0 %	90962709
16	NC_007930	CAA	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962710
17	NC_007930	AAAGA	2	10	1163	1172	80 %	0 %	20 %	0 %	90962710
18	NC_007930	ATG	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962710
19	NC_007930	TAA	2	6	1325	1330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962710
20	NC_007930	GTT	2	6	1333	1338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962710
21	NC_007930	AAC	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962710
22	NC_007930	AATC	2	8	1498	1505	50 %	25 %	0 %	25 %	90962710
23	NC_007930	AAT	2	6	1510	1515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962710
24	NC_007930	ATT	3	9	1524	1532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962710
25	NC_007930	A	6	6	1591	1596	100 %	0 %	0 %	0 %	90962710
26	NC_007930	A	6	6	1600	1605	100 %	0 %	0 %	0 %	90962710
27	NC_007930	AT	3	6	1607	1612	50 %	50 %	0 %	0 %	90962710
28	NC_007930	AAT	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962710
29	NC_007930	GAA	2	6	1764	1769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962710
30	NC_007930	ATT	2	6	1770	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962710
31	NC_007930	TA	3	6	1793	1798	50 %	50 %	0 %	0 %	90962710
32	NC_007930	AAG	2	6	1811	1816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962710
33	NC_007930	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962710
34	NC_007930	ATC	2	6	1885	1890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962710
35	NC_007930	TTAC	2	8	1938	1945	25 %	50 %	0 %	25 %	90962710
36	NC_007930	GAT	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962710
37	NC_007930	TAT	2	6	2027	2032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962710
38	NC_007930	A	7	7	2042	2048	100 %	0 %	0 %	0 %	90962710
39	NC_007930	A	6	6	5301	5306	100 %	0 %	0 %	0 %	90962711
40	NC_007930	TAT	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962711
41	NC_007930	ATAAAG	2	12	5475	5486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90962711
42	NC_007930	ATC	2	6	5500	5505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962711
43	NC_007930	AGA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962711
44	NC_007930	ATTGAA	2	12	5552	5563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	90962711
45	NC_007930	GTAT	2	8	5601	5608	25 %	50 %	25 %	0 %	90962711
46	NC_007930	T	6	6	5614	5619	0 %	100 %	0 %	0 %	90962711
47	NC_007930	GAAA	2	8	5621	5628	75 %	0 %	25 %	0 %	90962711
48	NC_007930	TTC	2	6	5657	5662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962711
49	NC_007930	AAAG	2	8	5665	5672	75 %	0 %	25 %	0 %	90962711
50	NC_007930	CCA	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90962711
51	NC_007930	ATT	2	6	5768	5773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962711
52	NC_007930	TTC	2	6	5778	5783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962711
53	NC_007930	CGTT	2	8	5795	5802	0 %	50 %	25 %	25 %	90962711
54	NC_007930	TTGA	2	8	5819	5826	25 %	50 %	25 %	0 %	90962711
55	NC_007930	TTG	2	6	5844	5849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962711
56	NC_007930	AAG	2	6	5902	5907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962711
57	NC_007930	AGA	2	6	5944	5949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962711
58	NC_007930	TGA	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962711
59	NC_007930	GAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962711
60	NC_007930	TGG	2	6	6123	6128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90962712
61	NC_007930	A	7	7	6145	6151	100 %	0 %	0 %	0 %	90962712
62	NC_007930	ACAAA	2	10	6156	6165	80 %	0 %	0 %	20 %	90962712
63	NC_007930	TGA	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962712
64	NC_007930	ATA	2	6	6299	6304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962712
65	NC_007930	AAG	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962712
66	NC_007930	A	6	6	6445	6450	100 %	0 %	0 %	0 %	90962712
67	NC_007930	AACA	2	8	6917	6924	75 %	0 %	0 %	25 %	90962713
68	NC_007930	ATTT	2	8	7028	7035	25 %	75 %	0 %	0 %	90962713
69	NC_007930	AAT	3	9	7036	7044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962713
70	NC_007930	AGT	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962713
71	NC_007930	AAG	2	6	7478	7483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962713
72	NC_007930	TGT	2	6	7515	7520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962713
73	NC_007930	ATG	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962713
74	NC_007930	T	6	6	7582	7587	0 %	100 %	0 %	0 %	90962713
75	NC_007930	GA	3	6	7697	7702	50 %	0 %	50 %	0 %	90962713
76	NC_007930	TTGT	2	8	7771	7778	0 %	75 %	25 %	0 %	90962713
77	NC_007930	AAAT	2	8	7842	7849	75 %	25 %	0 %	0 %	90962713
78	NC_007930	GTT	2	6	7912	7917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962713
79	NC_007930	A	6	6	7969	7974	100 %	0 %	0 %	0 %	90962713
80	NC_007930	AAC	2	6	8096	8101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962713
81	NC_007930	T	7	7	8303	8309	0 %	100 %	0 %	0 %	90962714
82	NC_007930	AGT	2	6	8378	8383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962714
83	NC_007930	CAT	2	6	8412	8417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962714
84	NC_007930	ATA	2	6	8515	8520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962714
85	NC_007930	TA	3	6	8533	8538	50 %	50 %	0 %	0 %	90962714
86	NC_007930	TATT	2	8	8569	8576	25 %	75 %	0 %	0 %	90962714
87	NC_007930	T	7	7	8575	8581	0 %	100 %	0 %	0 %	90962714
88	NC_007930	AT	3	6	8607	8612	50 %	50 %	0 %	0 %	90962714
89	NC_007930	TTAA	2	8	8751	8758	50 %	50 %	0 %	0 %	90962715
90	NC_007930	AGC	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90962715
91	NC_007930	GTT	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
92	NC_007930	CAC	2	6	8966	8971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90962715
93	NC_007930	GCCATT	2	12	8987	8998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	90962715
94	NC_007930	GCT	2	6	9019	9024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90962715
95	NC_007930	TTG	2	6	9117	9122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
96	NC_007930	TTG	2	6	9140	9145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
97	NC_007930	TCT	2	6	9202	9207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962715
98	NC_007930	AAT	2	6	9220	9225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
99	NC_007930	AGA	2	6	9279	9284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962715
100	NC_007930	GTTT	2	8	9480	9487	0 %	75 %	25 %	0 %	90962715
101	NC_007930	ATT	2	6	9522	9527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962715
102	NC_007930	TA	3	6	9536	9541	50 %	50 %	0 %	0 %	90962715
103	NC_007930	TAA	2	6	9585	9590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
104	NC_007930	AAG	2	6	9608	9613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962715
105	NC_007930	AAT	2	6	9649	9654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
106	NC_007930	TCT	2	6	9700	9705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962715
107	NC_007930	ACA	2	6	9730	9735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962715
108	NC_007930	GCT	2	6	9775	9780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90962715
109	NC_007930	GTT	2	6	9971	9976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
110	NC_007930	ATA	2	6	9991	9996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
111	NC_007930	ATT	2	6	10056	10061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962715
112	NC_007930	TG	3	6	10067	10072	0 %	50 %	50 %	0 %	90962715
113	NC_007930	CAT	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
114	NC_007930	TAA	2	6	10137	10142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
115	NC_007930	AAT	2	6	10279	10284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
116	NC_007930	CAT	2	6	10332	10337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
117	NC_007930	ATC	2	6	10365	10370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
118	NC_007930	CCA	2	6	10371	10376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90962715
119	NC_007930	TGA	2	6	10405	10410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962715
120	NC_007930	CAA	2	6	10436	10441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962715
121	NC_007930	TAA	2	6	10476	10481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
122	NC_007930	ATA	2	6	10587	10592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
123	NC_007930	CAAAGG	2	12	10727	10738	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	90962715
124	NC_007930	AGT	2	6	10764	10769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962715
125	NC_007930	TCA	2	6	10885	10890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
126	NC_007930	GTT	2	6	10943	10948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
127	NC_007930	AAG	2	6	10973	10978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962715
128	NC_007930	CAT	2	6	10989	10994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
129	NC_007930	ATC	2	6	11079	11084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
130	NC_007930	TTTTC	2	10	11204	11213	0 %	80 %	0 %	20 %	90962715
131	NC_007930	TAAA	2	8	11226	11233	75 %	25 %	0 %	0 %	90962715
132	NC_007930	TTGG	2	8	11246	11253	0 %	50 %	50 %	0 %	90962715
133	NC_007930	ATT	2	6	11284	11289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962715
134	NC_007930	ATT	2	6	12142	12147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962716
135	NC_007930	TTCAT	2	10	12210	12219	20 %	60 %	0 %	20 %	90962716
136	NC_007930	AT	3	6	12261	12266	50 %	50 %	0 %	0 %	90962716
137	NC_007930	TGGAAG	2	12	12284	12295	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	90962716
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